中國科學院病原微生物與**學重點實驗室多年來一直從事流感病毒病原學、**學及跨種間傳播機制方面的研究，近期在豬流感病原學研究方面取得新進展。發現我國豬群沒有H5N1的感染，但H3N2，H1N1，H9N2的感染是存在的，而且近年來人流感病毒和豬流感病毒在豬體中的重排現象有所增加。結果分別發表在《**共患病學和公共衛生》（Zoonosesａnd Public Health）（2009,doi:10.1111/j.1863-2378.2009.01270.x）和《臨床病毒學期刊》（Journal of ClinicalVirology （2009,44:141-144））。
豬是流感病毒跨種間傳播的中間宿主。20世紀暴發的3次人類大流感都與豬流感密切相關，其流行株都經過豬體內基因重排或突變。此次墨西哥流感的流行毒株是由豬流感、人流感和禽流感三種流感病毒的基因片段經基因重排而得到的新型變異毒株，豬在此變異毒株的形成過程中極有可能發揮了重要的中間宿主的作用。
實驗室分別對2004年和2007年福建省9個地區的養豬場進行了血清學監測，在1407份血清中，沒有檢測到H5N1亞型陽性抗體，說明H5N1病毒并沒有在豬群廣泛傳播，只是在一些地區有偶然感染事件發生。福建地區豬群感染H1和H3亞型流感病毒非常普遍，H1陽性率為47%，H3陽性率為28%，其中H1占**優勢，連續兩年的陽性率都在50%左右。此外，H9陽性率雖然不高，但考慮其重要的公共衛生意義，其流行情況仍值得關注。
H3N2亞型流感病毒主要存在于人群和豬群中，自1968年以來在全世界范圍內廣泛流行。實驗室成功分離到5株H3N2亞型人流感病毒和4株H3N2亞型豬流感病毒，這9個毒株均于2005年分離自我國廣東省。為了確定同一時期同一地區H3N2亞型人流感病毒和豬流感病毒的遺傳相關性，將這些毒株的全基因組序列進行了**分析。5株H3N2亞型人流感病毒的各基因片段均來源于同期的H3N2亞型人流感病毒，而4株H3N2亞型豬流感病毒除個別毒株的個別基因外，均來源于前期的H3N2亞型人流感病毒。豬體中未分離到同期的H3亞型人流感毒株。以上結果表明豬流感病毒比人流感病毒進化要慢一些，這可能是因為豬的生長周期有限，其所受的**選擇壓力遠遠小于人所受的**選擇壓力，而且人流感病毒在豬體中需要有一個很長的適應過程。另外，4株豬流感病毒中有2株發生了基因重排，表明近年來流感病毒在豬體中的重排現象有所增加。其中1株豬流感病毒的M和NS基因來源于H1N1亞型豬流感病毒，HA、NA及其他基因均來源于前期的H3N2亞型人流感病毒。另1株豬流感病毒的PA基因來源于H1N1亞型豬流感病毒，其他基因來源于前期的H3N2亞型人流感病毒。表明人和豬的密切接觸將導致流感病毒的跨種間傳播并產生新基因型的重組流感毒株，這對于人類健康無疑是一個很大的威脅。
以上研究表明我國豬群中豬流感病毒日趨復雜，迫切需要建立長期有效的病原學監測體系，以掌握豬流感病毒的流行和遺傳變異情況。該研究為我國建立科學而有效的**預警體系奠定了重要的理論基礎。實驗室將建立長期的病原監測體系，并建立我國人群和豬群對墨西哥流行毒株易感性的**學評估體系。
